安徽中医药大学继续教育学院始于1962年，当时经批准成立安徽中医学院成人教育进修函授部，招收中医专业函授生。1983年经省教委批准，将原来的进修部和函授部合并为培训部。1987年学校将培训部改为成人教育处。1993年经安徽省教育委员会批准成立安徽中医学院成人教育学院。是全国第一所中医药类二级学院。2008年底学校将其更名为继续教育学院。学院办学地点在学校梅山路校区，授课教师全部由中医药大学教师担任。学院下设综合科、教学管理部、学生管理部、培训部、同等学力教育部、职业技能等级认定中心。现有教职工14人，学历教育在校生10000余人，非学历教育每年5000余人次。学院根据成人教育社会性，职业性特点，主要办学模式有学历教育、非学历培训、同等学力教育、职业技能等级认定等。设有中医学、中西医临床医学、针灸推拿学、药学、中药学、护理学6个本科专业。